농업을 시작한 이래로 인간은 품질 좋은 농산물을 보다 많이 수확하는 것을 한결같이 추구해왔다. 이러한 인간의 소망은 자연스럽게 질병과 해충으로부터 농작물을 보호하는 일련의 노력으로 이어졌고 이러한 노력의 결정체로 응용생물학이 탄생하였다.

응용생물학은 농작물에 해를 끼치는 식물병원성 미생물과 해충, 그리고 이들이 상호작용하는 공간인 농업생태계를 주제로 연구를 수행하며 연구 대상에 따라 곤충학 분야와 식물미생물학 분야로 대별된다.

곤충학이란 곤충의 제반 현상 및 곤충과 인간의 관계를 과학적으로 연구하는 학문이다. 곤충은 현재 학계에 보고되어 있는 동식물 종의 약 80%를 차지할 정도로 수와 양적으로 다양하고 풍부하여 우리 주변에서 쉽게 볼 수 있는 친숙한 존재이다. 이들은 생태계의 영양단계에서 일차, 이차 소비자 층의 주축으로 에너지 흐름의 주요 기능을 담당하고 또한 상당수의 종들이 우리 인간과 경쟁관계 또는 공생관계를 맺고 있어 어떤 동물군보다 인간생활에 막대한 영향을 주고 있다.

18~19세기 초기, 곤충학은 분류학상의 기재 및 생활사 등의 기초적인 생태 연구 수준으로 시작되었으나 1900년대 이후, 해충방제와 관련하여 미국 및 유럽 국가들을 중심으로 응용곤충학이 중요시되면서 비약적으로 발전하여 오늘날에는 분류학·형태학·생태학·생리학·행동학·유전학·약리학·독성학·병리학·분자생물학·생명공학 등 여러 분야에서 다양한 연구가 이루어지고 있다.

우리나라에서는 1946년 서울대학교 개교이래 응용생물학전공의 전신인 농생물학과를 중심으로 농업해충에 관련한 많은 연구를 수행해 왔다. 최근에는 경제 성장과 무역량의 급증, 삶의 질 향상에 따른 도시해충, 위생해충, 검역해충, 산림해충에 대한 수요와 관심이 커감에 따라 이들에 대한 연구가 점차 연구의 중심이 되고 있다.

대학원 곤충학 전공과정에서는 6개의 전문 연구실(곤충생태학 연구실, 곤충계통분류학 연구실, 곤충생리학 연구실, 곤충분자생물독성학 연구실, 생리활성천연물곤충학 연구실, 곤충미생물공학 연구실)에서 작물과 인간에 해를 끼치는 농업해충 및 위생해충을 대상으로 해충의 분류 및 생리, 해충의 약제에 대한 저항성 문제(저항성 Gene의 탐색 및 Molecular Marker 개발, 저항성 발현 기작 연구, 새로운 생리억제 작용점 탐색), 해충에 대한 생물농약의 탐색과 개발(Bt Toxin, Baculovirus, BEVS, 해충에 생리활성을 나타내는 천연물 탐색, 천적의 탐색과 개발), 해충에 대한 모든 대응수단의 종합적이며 효율적인 운용(IPM)에 관한 연구 등을 수행하고 있다.

대학원 식물 미생물학 전공은 식물병원체와 환경미생물의 학문적 연구를 바탕으로 식물병의 효과적인 방제 및 화경 보호기술의 연구 개발을 목표로 하고 있는 전공분야이다. 구체적인 연구분야로는 곰팡이, 바이러스, 세균, 선충에 의한 식물병 발생 메커니즘 및 역학, 미생물의 독소에 관한 연구를 수행하고 있는데, 이들 연구는 식물병의 진단 및 방제법 개발 등의 분야에서부터 병원성 관련 기작 연구 및 유전자 변형을 이용한 병저항성 식물의 개발 등 분자생물학적 방법을 이용한 첨단 생명과학분야를 아우르고 있다.

응용생물학 전공은 학부에서는 하나의 전공으로 곤충학과 식물미생물학의 내용을 함께 배우고 대학원에서는 각각의 전공으로 나뉘어져 깊이있는 연구를 수행할 수 있도록 하고 있다.